毒奶政策一日三變(檢測三聚氰胺含量標準由 0 ppm提升為2.5 ppm)，衛生署長林芳郁為此請辭負責，綠營立委大罵該負責的不只林芳郁吧！賴清德表示，「如果林芳郁要下臺，劉兆玄更應該下臺，不應該找林芳郁當替死鬼，劉兆玄應該要下臺，馬英九應該要道歉。」翁金珠也說，「行政院應該讓他（指林芳郁）請辭，而且連院長都應該辭職，整個內閣都應該改組。」
相對的，藍營立委認為，雖有人必須為此負責，但罪不致劉揆，而先前要求林芳郁馬上下臺，喊的最大聲的立委林郁方，則肯定林芳郁是個好人，但是不符合官場文化的需求，「我的確希望林署長能夠原諒林立委，但我還是堅持我的看法，我覺得（應該）讓這麼好的一位學者，這麼正派的一位醫學院長，回去做他比較熟悉，他可能比較喜歡的工作。」
藍營同時擔心林芳郁的請辭，會引爆閣員下臺的骨牌效應，立委邱毅就說，「內閣已經像一個繃得很緊的橡皮圈，現在就怕哪個地方出現一個缺口，所以如果有一個人撐不住了、下來了，會有骨牌效應。」綠營批政府對毒奶檢驗標準大轉彎，林芳郁請辭會只是個案，還是會引發請辭風潮？考驗正將開始。
